Gymnázium Nymburk se v oblasti práce na projektech financovaných EU řadí jednoznačně mezi nejaktivnější školy ČR.
Prvními projekty, do nichž se škola zapojila, byly projekty zaměřené na mezinárodní spolupráci škol. Jednalo se o projekty pod hlavičkou programu Socrates, resp. Comenius či Arion.
Zkušenosti s přípravou a administrací projektů zúročila škola v dalším období v projektech financovaných Evropským sociálním fondem a Operačním programem Rozvoje lidských zdrojů a následně projekty zařazenými do Operačního programu Vzdělávání pro konkurenceschopnost.
Účast v projektech přináší škole kromě jisté prestiže zejména zcela jiné možnosti práce ve škole. Vyučující prochází nadstandardními školeními, zlepšuje se materiální vybavení školy a ve svém důsledku tak z projektových aktivit školy profitují zejména žáci školy. Ti se také na naprosté většině projektů přímo podílejí a získávají tak zkušenosti, které na vysokých školách zcela jistě využijí.